Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc183A2AJB1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms