Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhbdl2A2AGA4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhbdl2A2AGA4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms