Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700023F06RikA2AB62 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms