Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrp1bA1Z198 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms