Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam71e1A1L3C1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms