Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trav12-2A0N8N6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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