Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc173A0JLY1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc173A0JLY1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms