Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rfc5Q9D0F6 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rfc5Q9D0F6 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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