Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr237-ps1-202ENSMUST00000215911 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm23468-201ENSMUST00000157125 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm22772-201ENSMUST00000104451 121 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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