Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxb2P0C1T1 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
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