Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Col5a3Q9JLI2 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Col5a3Q9JLI2 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Col5a3Q9JLI2 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Col5a3Q9JLI2 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col5a3Q9JLI2 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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