Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
OtofQ9ESF1 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
OtofQ9ESF1 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.8 ms