Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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