Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccdc18Q640L5 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Ccdc18Q640L5 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms