Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm26441-201ENSMUST00000082590 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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