Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms