Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Usp48Q3V0C5 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Usp48Q3V0C5 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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Usp48Q3V0C5 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Usp48Q3V0C5 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Usp48Q3V0C5 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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Usp48Q3V0C5 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp48Q3V0C5 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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