Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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