Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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