Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cpne9Q1RLL3 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms