Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Rpusd2Q149F1 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rpusd2Q149F1 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rpusd2Q149F1 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rpusd2Q149F1 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rpusd2Q149F1 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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