Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Traf3ip1Q149C2 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms