Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd9P28357 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd9P28357 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd9P28357 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Hoxd9P28357 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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