Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Hnrnph2-204ENSMUST00000113202 3988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Tbc1d14-221ENSMUST00000171385 3884 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hoxd11P23813 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms