Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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