Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Usp48Q3V0C5 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp48Q3V0C5 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms