Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Rnf180Q3U827 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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