Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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