Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Rpusd2Q149F1 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rpusd2Q149F1 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms