Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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