Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Rpusd2Q149F1 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Rpusd2Q149F1 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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