Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cldn18P56857 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms