Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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PtpreP49446 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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