Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms