Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms