Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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