Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms