Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms