Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm22354-201ENSMUST00000083919 70 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim35Q8C006 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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