Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ubash3bQ8BGG7 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ubash3bQ8BGG7 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ubash3bQ8BGG7 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ubash3bQ8BGG7 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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Ubash3bQ8BGG7 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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