Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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PtprnQ60673 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PtprnQ60673 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PtprnQ60673 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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PtprnQ60673 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PtprnQ60673 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms