Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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