Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26425-201ENSMUST00000122529 82 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm11333-201ENSMUST00000119479 148 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 AC166341.8-201ENSMUST00000221267 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Vsig1-201ENSMUST00000033806 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Bves-201ENSMUST00000095715 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd11P23813 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms