Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxb1P17919 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxb1P17919 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Hoxb1P17919 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms