Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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DffaO54786 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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DffaO54786 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
DffaO54786 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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DffaO54786 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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DffaO54786 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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DffaO54786 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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DffaO54786 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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