Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms