Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RpainQ9CWY9 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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