Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Rnf40Q3U319 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Rnf40Q3U319 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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Rnf40Q3U319 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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