Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Col4a3Q9QZS0 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms