Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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Col5a3Q9JLI2 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Col5a3Q9JLI2 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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Col5a3Q9JLI2 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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